Der "kleine" Robert sagt (meine Übersetzung und Zusammenfassung):
secretaire erster Nachweis 1370. Wortherkunft: lat. secretarium, secretus (= geheimer Bereich, geheim).
I. Bedeutungsfeld:
1. veraltet für eine Person, die einer höherrangigen Person Texte oder Briefe redigiert. ZB Sekretär eines Königs. Daraus entwickelte sich die Bedeutung "Staatssekretär" und Minister.
2. Seit 1636 auch die heutige Bedeutung von Sekretär, zB jemand, der sich um eine Organisation kümmert; Angestellter mit einer bestimmten Aufgabe usw.
3. Seit dem 17. Jh.: Allgemein jemand, der einem andern im Namen eines Dritten schreibt. Daraus dann auch die heutige Bedeutung des Sekretärs im engeren Sinne von Assistent.
II. Das Möbelstück Sekretär (seit 1745 lt. Pt Robert). Schreibtisch mit Schubladen zur Aufbewahrung von Schriftstücken.
III. Seit 1775 zoologisch: eine Vogelart.
Für noch Genaueres, einfach den "großen" Robert konsultieren. Im deutschen Grimm taucht das Wort nicht auf oder ich habe nicht genau genug gesucht. Vielleicht gibt es auch sowas wie ein Deutsches Etymologisches Wörterbuch.
PS Nach einer Konsultation des Zedler würde ich vermuten, dass das Wort Sekretär möglicherweise nicht aus dem Französischen, sondern direkt aus dem Lateinischen übernommen wurde, der Zedler kennt das Wort "Secretarius" im Sinne von Sekretär oder Staatssekretär in Hülle und Fülle, siehe :
Zedler
Also, ich denke, dass das Wort aus dem Lateinischen ins Deutsche übernommen wurde, und das vermutlich weit vor Ende des 18. Jh.s.